Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABARAPL3Q9BY60 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms