Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC46A2Q9BY10 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC46A2Q9BY10 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms