Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms