Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C1QTNF4Q9BXJ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1QTNF4Q9BXJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms