Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VN1R3Q9BXE9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VN1R3Q9BXE9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms