Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PBDC1Q9BVG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBDC1Q9BVG4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms