Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM62Q9BVG3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms