Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf50Q9BV19 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf50Q9BV19 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms