Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPOQ9BU64 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms