Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RSG1Q9BU20 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms