Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCMBPQ9BTE3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms