Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM29Q9BSF4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms