Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC50A1Q9BRV3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC50A1Q9BRV3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms