Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF2Q9BQY4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms