Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FYCO1Q9BQS8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FYCO1Q9BQS8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms