Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOQ99835 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOQ99835 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOQ99835 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOQ99835 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOQ99835 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOQ99835 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOQ99835 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOQ99835 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMOQ99835 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMOQ99835 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMOQ99835 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMOQ99835 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMOQ99835 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms