Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD5Q99666 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms