Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPXM1Q96SM3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPXM1Q96SM3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms