Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIGSQ96S52 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGSQ96S52 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms