Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A12Q96S37 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A12Q96S37 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms