Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALS2CR12Q96Q35 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms