Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRNT1Q96Q11 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRNT1Q96Q11 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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