Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMTK3Q96Q04 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms