Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP4Q96PP9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms