Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP57Q96MR6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP57Q96MR6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms