Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE3Q96MG7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE3Q96MG7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms