Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf85Q96MD7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms