Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC114Q96M63 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms