Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC17Q96LX7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms