Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EP400Q96L91 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms