Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM87BQ96K49 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms