Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHDQ96IW2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHDQ96IW2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms