Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
BCANQ96GW7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BCANQ96GW7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms