Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTV1Q96GA3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTV1Q96GA3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTV1Q96GA3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTV1Q96GA3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTV1Q96GA3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LTV1Q96GA3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTV1Q96GA3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTV1Q96GA3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LTV1Q96GA3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTV1Q96GA3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms