Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM63Q969Q1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRIM63Q969Q1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRIM63Q969Q1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRIM63Q969Q1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRIM63Q969Q1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRIM63Q969Q1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRIM63Q969Q1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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