Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKD1Q969G9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKD1Q969G9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms