Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG4AQ8WYN0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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ATG4AQ8WYN0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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ATG4AQ8WYN0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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ATG4AQ8WYN0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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ATG4AQ8WYN0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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ATG4AQ8WYN0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4AQ8WYN0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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