Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF4Q8WV16 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF4Q8WV16 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms