Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF2Q8TEC5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF2Q8TEC5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms