Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ACER1Q8TDN7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACER1Q8TDN7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms