Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTRT1Q8TDG2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms