Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE22Q8NFJ8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHE22Q8NFJ8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms