Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms