Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms