Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms