Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNLDC1Q8NA58 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNLDC1Q8NA58 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms