Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC63Q8NA47 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms