Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL3Q8N8U3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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