Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD12Q8N8I0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD12Q8N8I0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms