Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00612Q8N6U2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms